Biológia Intézet
Schmack-Viessmann GmbH, Novozymes, BIOGEST GmbH, TEVA Zrt., Zöldforrás Kft., Biosopin Kft., Pize-Nagy Kft., Pannonpharma, Pannon-Trade Kft, Solvo Zrt., BASF The Chemical Company
Fizikai Intézet
Dél-Alföldi Élet- és Anyagtudományi Kooperációs Kutatóközpont, Knorr-Bremse, MOL Nyrt., Semilab Zrt., Videoton Holding Zrt.
Földrajzi és Földtudományi Intézet
Mecsekérc Kft., Geochem Kft., TXM olaj- és Gázkutató Kft., Golder Associates Zrt., Coca-Cola, Mecsek-Öko Környezetvédelmi Zrt., OMSZ, Kulturális Örökségvédelmi Hivatal, MOL Nyrt, Geodézia Zrt., ATIVIZIG, Kiskunsági Nemzeti Park, INTERGEO Kft., BOREAS Kft., ESRI
Informatikai Intézet
Exxon Mobil Kft., Siemens Zrt., Vodafone Magyarország Zrt., Lochner Kft., HVG Zrt., GE Hungary Kft., OMRON Electronics Kft., Telenor, Ericsson, Nokia, Samsung, National Instruments, GE Healthcare, Omron, Contitech Fluid Automotive Hungaria Kft., Antarktisz Kft., Arm Ltd., Dgia Plc., Multiráció Kft., R&R Software Zrt., Szeged Software Zrt., Procontrol Kft., FrontEndART Kft., AENSYs Kft., H-Lab Kft., HighTec Kft., Combit Zrt., Evista Kft., Dopti Kft., SNW Systems Kft
Kémiai Intézet
Paksi Atomerőmű, Tisza-Volán Zrt., Richter-Gedeon Nyrt., Firmenich SA , Contitech Rubber Industrial Kft., General Elecrtric Hungary Kft., BHP Billiton Pty. Ltd., Europe Match GmbH
Környezettudományi és Műszaki Intézet
Szoros kapcsolat a környezetvédelmi, természetvédelmi és vízügyi felügyelőségekkel és igazgatóságokkal és az ebben illetékes államigazgatási szervekkel